Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSHP51688 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSHP51688 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSHP51688 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSHP51688 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSHP51688 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSHP51688 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSHP51688 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSHP51688 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSHP51688 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGSHP51688 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGSHP51688 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms