Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPC3P51654 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPC3P51654 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPC3P51654 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC3P51654 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC3P51654 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPC3P51654 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPC3P51654 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPC3P51654 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPC3P51654 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GPC3P51654 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms