Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSEN2P49810 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms