Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VEGFBP49765 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VEGFBP49765 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VEGFBP49765 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms