Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGFP49763 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGFP49763 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGFP49763 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGFP49763 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGFP49763 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGFP49763 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGFP49763 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGFP49763 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGFP49763 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGFP49763 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGFP49763 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms