Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUMBP49757 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUMBP49757 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUMBP49757 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUMBP49757 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUMBP49757 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUMBP49757 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUMBP49757 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUMBP49757 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUMBP49757 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms