Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCT3P49368 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCT3P49368 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCT3P49368 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCT3P49368 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT3P49368 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCT3P49368 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCT3P49368 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT3P49368 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms