Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIP4K2AP48426 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms