Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJA8P48165 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJA8P48165 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJA8P48165 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJA8P48165 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA8P48165 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA8P48165 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA8P48165 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA8P48165 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA8P48165 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJA8P48165 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA8P48165 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA8P48165 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA8P48165 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJA8P48165 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJA8P48165 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJA8P48165 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJA8P48165 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GJA8P48165 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GJA8P48165 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms