Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ1P48048 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNJ1P48048 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms