Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RECQLP46063 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RECQLP46063 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RECQLP46063 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RECQLP46063 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RECQLP46063 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RECQLP46063 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RECQLP46063 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RECQLP46063 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RECQLP46063 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RECQLP46063 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RECQLP46063 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RECQLP46063 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms