Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFMP43652 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AFMP43652 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AFMP43652 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AFMP43652 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AFMP43652 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AFMP43652 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFMP43652 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFMP43652 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFMP43652 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFMP43652 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AFMP43652 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFMP43652 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFMP43652 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFMP43652 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFMP43652 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFMP43652 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFMP43652 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AFMP43652 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AFMP43652 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AFMP43652 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms