Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP2P42575 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP2P42575 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP2P42575 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CASP2P42575 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CASP2P42575 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASP2P42575 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP2P42575 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms