Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA1P42261 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIA1P42261 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIA1P42261 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms