Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MDH1P40925 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MDH1P40925 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MDH1P40925 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDH1P40925 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDH1P40925 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
MDH1P40925 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDH1P40925 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MDH1P40925 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MDH1P40925 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms