Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GGCXP38435 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GGCXP38435 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GGCXP38435 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGCXP38435 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGCXP38435 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGCXP38435 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GGCXP38435 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GGCXP38435 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GGCXP38435 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GGCXP38435 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GGCXP38435 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GGCXP38435 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GGCXP38435 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GGCXP38435 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms