Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDFT1P37268 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDFT1P37268 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms