Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKAP35790 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKAP35790 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHKAP35790 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHKAP35790 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHKAP35790 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHKAP35790 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHKAP35790 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHKAP35790 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHKAP35790 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHKAP35790 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHKAP35790 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHKAP35790 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms