Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPN7P35236 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms