Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ABCC1P33527 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
ABCC1P33527 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms