Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC6A4P31645 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms