Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD11P31277 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms