Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXC9P31274 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC9P31274 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC9P31274 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms