Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXA13P31271 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXA13P31271 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms