Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA5P30532 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA5P30532 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA5P30532 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA5P30532 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA5P30532 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA5P30532 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA5P30532 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms