Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGA1P29973 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGA1P29973 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms