Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD40LGP29965 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CD40LGP29965 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms