Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCAP28676 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCAP28676 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCAP28676 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCAP28676 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCAP28676 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCAP28676 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCAP28676 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCAP28676 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCAP28676 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCAP28676 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms