Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms