Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFP26441 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFP26441 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFP26441 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFP26441 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFP26441 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNTFP26441 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNTFP26441 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNTFP26441 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNTFP26441 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNTFP26441 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNTFP26441 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNTFP26441 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CNTFP26441 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNTFP26441 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTFP26441 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTFP26441 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTFP26441 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTFP26441 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTFP26441 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CNTFP26441 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFP26441 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFP26441 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFP26441 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFP26441 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFP26441 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNTFP26441 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNTFP26441 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms