Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR2AP24928 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms