Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PAX3P23760 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAX3P23760 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAX3P23760 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAX3P23760 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PAX3P23760 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX3P23760 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX3P23760 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX3P23760 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX3P23760 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAX3P23760 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAX3P23760 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX3P23760 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX3P23760 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX3P23760 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX3P23760 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAX3P23760 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX3P23760 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX3P23760 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX3P23760 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAX3P23760 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAX3P23760 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAX3P23760 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms