Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYF6P23409 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYF6P23409 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYF6P23409 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MYF6P23409 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MYF6P23409 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MYF6P23409 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms