Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HRCP23327 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HRCP23327 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HRCP23327 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HRCP23327 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HRCP23327 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HRCP23327 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HRCP23327 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HRCP23327 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HRCP23327 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HRCP23327 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HRCP23327 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HRCP23327 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HRCP23327 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HRCP23327 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HRCP23327 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HRCP23327 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HRCP23327 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HRCP23327 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HRCP23327 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HRCP23327 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HRCP23327 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HRCP23327 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
HRCP23327 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
HRCP23327 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
HRCP23327 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HRCP23327 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HRCP23327 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HRCP23327 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HRCP23327 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HRCP23327 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HRCP23327 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HRCP23327 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HRCP23327 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HRCP23327 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HRCP23327 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
HRCP23327 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HRCP23327 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HRCP23327 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
HRCP23327 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HRCP23327 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HRCP23327 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HRCP23327 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HRCP23327 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
HRCP23327 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HRCP23327 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HRCP23327 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HRCP23327 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HRCP23327 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HRCP23327 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
HRCP23327 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms