Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TBPP20226 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBPP20226 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBPP20226 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBPP20226 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBPP20226 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBPP20226 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBPP20226 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TBPP20226 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TBPP20226 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBPP20226 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBPP20226 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TBPP20226 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TBPP20226 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TBPP20226 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TBPP20226 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBPP20226 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBPP20226 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBPP20226 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBPP20226 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBPP20226 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TBPP20226 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms