Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2EP19388 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2EP19388 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms