Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VCAM1P19320 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms