Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT4P19013 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT4P19013 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT4P19013 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT4P19013 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT4P19013 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT4P19013 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT4P19013 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRT4P19013 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRT4P19013 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRT4P19013 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRT4P19013 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms