Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6AP16499 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms