Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPCAMP16422 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPCAMP16422 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms