Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CREB1P16220 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CREB1P16220 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CREB1P16220 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CREB1P16220 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CREB1P16220 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CREB1P16220 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CREB1P16220 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms