Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DSPP15924 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DSPP15924 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DSPP15924 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DSPP15924 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DSPP15924 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DSPP15924 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DSPP15924 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSPP15924 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms