Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NME1P15531 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NME1P15531 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NME1P15531 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NME1P15531 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NME1P15531 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NME1P15531 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME1P15531 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME1P15531 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms