Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF2P15336 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF2P15336 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF2P15336 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF2P15336 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF2P15336 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF2P15336 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF2P15336 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF2P15336 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF2P15336 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF2P15336 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF2P15336 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF2P15336 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF2P15336 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATF2P15336 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms