Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRIM27P14373 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms