Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DOBP13765 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DOBP13765 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms