Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TMIGD3P0DMS9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TMIGD3P0DMS9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms