Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2MP0CAP2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2MP0CAP2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2MP0CAP2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 527.6 ms