Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L7P0C7H9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L7P0C7H9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms