Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC175P0C221 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC175P0C221 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms